審計部出全台有13座「蚊子館」，合計花費16億元新台幣。行政院公共工程委員會也承諾立委的質詢，表示1個月內將重新清查全台蚊子館，未來每季定期公布和改進。
審計部94年調查公共建設計畫執行績效，函請行政院改善蚊子館。總計專案小組共列管163處蚊子館，其中絕大多數都是「一鄉鎮市一停車場」政策下、無視需求興建的停車場乏人問津，還有不少市場、運動休閒場館及各種民眾活動中心、遊客中心閒置。
全台13座的公共設施與建造經費，包括花蓮縣環保科技園區：8億6044萬元。雲林縣三條崙海水浴場：2億3448萬元。花蓮縣多功能漁港漁業場館：1億2410萬元。台南市本淵寮市場：9695萬4千元。台南市將軍漁港觀光魚市直銷中心：8648萬元。雲林縣四湖農漁村生活文化館：5461萬3千元。屏東縣琉球鄉漁村生活文物館：3662萬2千元。花蓮縣無毒農業園區：3305萬4千元。桃園縣民生大樓：2502萬8千元。彰化縣台灣葡萄產業文化園區：2026萬5千元。台北市重慶托兒所：1637萬7千元。嘉義縣六腳倉庫鐵馬驛站：692萬6千元。台北市北投大業段回饋空間：無。
花蓮環科園區耗9億
全台十三座未提報行政院的蚊子館，由環保署補助設置的花蓮環保科技園區被指「最貴蚊子館」，耗資達九億元，由於地處偏遠、加上補助停止，廠商至一百年底全數撤離，二十二公頃園區迄今閒置近兩年！
環保署補助全台成立的四個環保科技園區，其中花蓮環科園區包括基礎建設、廠房、污水處理場、研究室、太陽能設施、展示大樓、環境教育展示館等，耗資八億六千零四十四萬元，九十七年十月啟用。當年駐廠商雖享有環保署、縣府的土地及廠房租金補貼，廠商只需自負廿％，且環保署也依各廠商提出的研發計畫，補貼研究經費，從九十六年起環保署共補助約四千多萬元，使得園區硬體建設費、加上補助費達九億。
花蓮官員錯誤評估
不過，花蓮園區地處偏遠，最多時僅十四家廠商進駐，均屬研發型廠商，在園區進行太陽能電池、生質柴油、太陽能熱水器、小型風力發電機、沼氣發電、無線網路設施等產品研發，由於沒有實際設廠生產，總員工只有七十人；至於實際設廠生產，業者則興趣缺乏，主要是距離港口超過五十公里，公路交通時常中斷，貨物運輸不便。
各項補助乃依照「環保科技園區推動計畫」進行，由於一百年底計畫屆滿，各項補助停止，加上縣府從九十九年就已停止招商，廠商至此全部撤走！環保署的錯誤政策，讓全體納稅人吃苦頭
